Di persekitaran habitat dan eko-sistemnya, lebah kelulut berinteraksi
dengan benda hidupan dan bukan hidupan, serta gaya hidupnya dipengaruhi oleh
faktor fizikal disekelilingnya.
Beberapa tumbuhan, haiwan dan serangga yang dijumpai dan menumpang hidup
di persekitarannya adalah seperti semut, anai-anai, labah-labah, cicak dan katak. Salah satu musuh utamanya adalah larva lalat di mana ianya
boleh mengganggu musnah keseluruhan koloni lebah kelulut, sekiranya keadaan tidak terkawal. Terdapat juga ulat dari
berbagai spesis serangga lain yang menyerang koloni lebah kelulut.
Spesis pemangsa seperti cicak, mengkarung dan labah-labah juga didapati
menunggu dan memakan lebah kelulut yang sedang pulang ke sarang. Monyet dan beruang juga didapati mencuri madu dan merosakkan sarang lebah kelulut.
Pada suatu ketika, manusia juga menjadi musuh dan ancaman utama kepada
lebah kelulut. Selain daripada mengambil madu dari sarangnya, kedapatan juga
manusia yang membakar sarang atau pun memotong musnah sarang lebah kelulut
sebagai sebahagian daripada aktiviti perladangan. Manusia juga menjalankan
aktiviti penyemburan racun serangga ke atas tanaman sehingga menyebabkan lebah
kelulut mati atau pun mencemarkan sumber pencariannya seperti polen, nektar,
damar dan air.
Lebah kelulut gemar kepada persekitaran hidup yang selamat dan sesuai
untuk kesinambungan hidupnya. Ia juga dipengaruhi oleh faktor persekitaran yang
memungkinkan memberi kesan kepada cuaca di sekelilingnya seperti faktor suhu
yang optima, udara yang terkawal dan kelembapan yang relatif.
Kebanyakan lebah kelulut menyukai suhu yang hangat dan aktif pada hari
yang panas dan sebaliknya kurang aktif pada waktu yang sejuk dan mendung. Lebah
kelulut akan memerap di dalam sarangnya pada waktu hujan dan pada waktu malam. Adakalanya, lebah kelulut lebih selesa
tinggal di sarang yang lebih tinggi dari permukaan bumi.
